教員情報 - 中村　建介 | 前橋工科大学

（最終更新日 : 2023-01-27 09:19:04）

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ナカムラ　ケンスケ KENSUKE NAKAMURA
中村　建介

所属前橋工科大学工学部生命情報学科

前橋工科大学大学院工学研究科生命情報学専攻（修士課程）

前橋工科大学大学院工学研究科環境・生命工学専攻（博士課程）

前橋工科大学工学部情報・生命工学群

職種教授

現在の専門分野
ゲノム生物学, 生命、健康、医療情報学キーワード(バイオインフォマティクス、微生物ゲノム解析、金属タンパク質、理論有機化学、次世代シーケンサ)

プロフィール
有機合成からはじめて、計算機化学、ドラッグデザイン、分子進化解析、シーケンサーデータの解析などに取り組んできました。趣味は散歩と写真と自然観察、多くの生き物を見て多様性を感じるのが楽しみです。

研究室
生物情報化学研究室：われわれ生物の姿や行動がどのようにして形作られているのかを知るために、ゲノムDNAの持つ「情報」を計算機で調べています。

技術相談・講演・共同研究に応じられるテーマ
次世代シーケンサーによる配列データの解析分子軌道計算・分子力場計算・分子動力学計算などによる計算化学解析タンパク質の配列および立体構造解析・基質との相互作用の解析

現在取り組んでいる研究内容
計算機を用いて、様々な角度から生命現象を明らかにして行く研究に取り組んでいます。生命現象のメカニズムを解明してゆく事は、我々の知的好奇心を満たすばかりでなく、医療、農学、新素材、エネルギー生産などへの幅広い応用が期待されています。次世代シーケンサは、ほんの十年程前には巨大な資金と労力を必要とした塩基配列の解読を、一つの研究室レベルの予算と労力で行う事を可能にしました。しかし次世代シーケンサから得られる塩基配列は大量の断片で、このデータを生物学的に有為な目的に応用するためには、計算機を用いた情報学的な解析が不可欠です。実験グループとの共同により、DNA上のタンパク質認識配列（タンパク質結合領域）解読の為の新しい技術の開発を進めています。また、シーケンサから得られた断片配列を繋ぎ合わせるアセンブルについて、生の実験データから最大限の情報を抽出する為の技術の開発を進めています。配列情報による分子進化や化合物合成系の解析、タンパク質と化学物質の相互作用を評価するための分子動力学計算など、これまでの手法の改良などを進めながら、生体を構成する化学物質の振る舞いを計算機上で再現し、可視化して行くための新たなフレームワークの構築に取り組んでいます。バイオインフォマティクスの世界では様々なプログラムが公開されており、初心者でも簡単に利用することも出来ますが、自分たちでプログラムを作って行くことで、他の人とは違う視点で現象を眺め、新しい発見につながる様な研究をしたいと考えています。

著書・論文歴
2021/08/12	論文	複製開始に、複製開始点oriCにDNA結合タンパク質IHFが優先的に結合することを全ゲノム解析により明らかにする微生物学のフロンティア 12 (共著)
2021/05/27	論文	Ultra-deep sequencing reveals dramatic alteration of organellar genomes in Physcomitrella patens due to biased asymmetric recombination 4 (共著)
2021	論文	Flocculation Type and the Lg-FLO1 Gene of Bottom-Fermenting Yeast Are Derived from Top-Fermenting Yeast Journal of the American Society of Brewing Chemists 79 (3),306-313頁 (共著)
2020	論文	Mutation and Deletion of PAD1 and/or FDC1 and Absence of Phenolic Off-flavor Production in Top and Bottom-Fermenting Yeasts Journal of the American Society of Brewing Chemists 78 (1),74-79頁 (共著)
2018	論文	GeF-seq: A Simple Procedure for Base Pair Resolution ChIP-seq Bacterial Chromatin,33-47頁 (共著)
全件表示（30件）

学会発表
2016/12/02	金属タンパク質データベースMetalMineの整備 (第39回日本分子生物学会年会)
2016/12/01	シーケンサー配列解析ソフトウェアmapsの開発とシーケンシングエラープロファイル解析 (第39回日本分子生物学会年会)
2015/12/01	次世代シーケンサーのベースコール精度の検証 (第38回日本分子生物学会年会BMB2015)
2015/03/06	Gef-seqに対応したマッピングプログラムおよびGUIの開発 (第９回日本ゲノム微生物学会年会)

研究課題・受託研究・科研費
2014/04 ～ 2017/03	機器の特性を考慮した次世代シーケンサー解析技術の高度化基盤研究(C)

学歴
1990/04 (学位取得)	慶應義塾大学大学院理工学研究科化学専攻博士（理学）

職歴
2022/04/01 ～	前橋工科大学工学部情報・生命工学群教授
2014/04/01 ～	前橋工科大学大学院工学研究科生命情報学専攻（修士課程）教授
2014/04/01 ～	前橋工科大学大学院工学研究科環境・生命工学専攻（博士課程）教授
2014/04/01 ～	前橋工科大学工学部生命情報学科教授
2012/04/01 ～ 2014/03/31	前橋工科大学工学部生命情報学科准教授

学内役職・委員
2022/04/01	前橋工科大学入試部長
2021/04/01 ～ 2022/03/31	前橋工科大学入試委員長
2019/04/01 ～ 2021/03/31	前橋工科大学図書・情報センター長
2015/04/01 ～ 2019/03/31	前橋工科大学生命情報学科長

所属学会
	ゲノム微生物学会
	日本バイオインフォマティクス学会
	日本化学会
	日本進化学会
	日本農芸化学会

ホームページ
生命情報化学研究室